Protein–RNA interactions for Protein: P02340

Tp53, Cellular tumor antigen p53, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53P02340 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tp53P02340 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tp53P02340 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tp53P02340 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tp53P02340 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tp53P02340 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tp53P02340 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tp53P02340 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tp53P02340 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tp53P02340 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tp53P02340 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tp53P02340 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tp53P02340 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tp53P02340 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tp53P02340 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tp53P02340 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tp53P02340 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tp53P02340 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tp53P02340 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tp53P02340 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tp53P02340 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tp53P02340 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tp53P02340 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tp53P02340 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tp53P02340 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tp53P02340 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tp53P02340 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tp53P02340 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tp53P02340 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tp53P02340 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tp53P02340 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tp53P02340 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tp53P02340 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tp53P02340 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tp53P02340 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tp53P02340 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tp53P02340 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tp53P02340 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tp53P02340 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tp53P02340 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms