Protein–RNA interactions for Protein: P01811

Ig heavy chain V region UPC10, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01811 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01811 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01811 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01811 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01811 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01811 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01811 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01811 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01811 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01811 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01811 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01811 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01811 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01811 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01811 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01811 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01811 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01811 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01811 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01811 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01811 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01811 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01811 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01811 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01811 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01811 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01811 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01811 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01811 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01811 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01811 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01811 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01811 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01811 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01811 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01811 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01811 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01811 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01811 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01811 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01811 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01811 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01811 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01811 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01811 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01811 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01811 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01811 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01811 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01811 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01811 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01811 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01811 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01811 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01811 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01811 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01811 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01811 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01811 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01811 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01811 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01811 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01811 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01811 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01811 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01811 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01811 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01811 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01811 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
P01811 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01811 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01811 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01811 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01811 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01811 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01811 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01811 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01811 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01811 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01811 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01811 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01811 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01811 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01811 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01811 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01811 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01811 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01811 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01811 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01811 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01811 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01811 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01811 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01811 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01811 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01811 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01811 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01811 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01811 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01811 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms