Protein–RNA interactions for Protein: P01739

T-cell receptor alpha chain V region 2B4, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01739 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01739 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01739 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01739 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01739 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01739 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01739 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01739 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01739 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01739 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01739 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01739 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01739 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01739 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01739 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01739 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01739 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01739 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01739 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01739 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01739 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01739 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01739 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01739 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01739 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01739 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01739 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01739 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01739 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01739 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01739 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01739 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01739 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01739 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01739 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01739 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01739 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01739 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01739 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01739 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01739 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01739 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01739 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01739 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01739 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01739 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01739 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01739 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01739 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01739 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01739 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01739 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01739 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01739 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01739 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01739 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01739 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01739 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01739 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01739 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01739 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01739 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01739 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01739 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01739 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01739 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01739 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01739 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01739 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01739 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01739 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01739 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01739 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01739 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01739 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01739 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01739 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01739 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01739 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01739 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01739 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01739 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01739 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01739 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01739 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01739 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01739 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01739 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01739 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01739 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01739 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01739 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01739 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01739 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01739 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01739 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01739 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01739 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01739 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01739 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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