Protein–RNA interactions for Protein: P01736

T-cell receptor beta chain V region PHDS203 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01736 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01736 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01736 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01736 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01736 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01736 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01736 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01736 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01736 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01736 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01736 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01736 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01736 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01736 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01736 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01736 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01736 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01736 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01736 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01736 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01736 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01736 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01736 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01736 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01736 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01736 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01736 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01736 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01736 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01736 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01736 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01736 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01736 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01736 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01736 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01736 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01736 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01736 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01736 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01736 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01736 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01736 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01736 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01736 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01736 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01736 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01736 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P01736 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01736 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01736 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01736 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01736 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01736 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01736 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01736 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01736 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01736 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01736 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01736 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01736 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01736 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
P01736 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01736 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01736 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
P01736 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01736 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01736 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01736 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01736 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01736 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01736 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01736 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01736 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01736 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01736 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01736 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01736 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01736 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01736 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01736 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01736 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01736 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01736 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01736 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01736 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01736 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01736 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01736 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01736 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
P01736 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01736 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01736 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01736 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01736 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01736 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01736 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01736 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01736 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01736 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01736 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms