Protein–RNA interactions for Protein: P01101

Fos, Proto-oncogene c-Fos, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosP01101 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FosP01101 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FosP01101 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FosP01101 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FosP01101 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FosP01101 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FosP01101 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FosP01101 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FosP01101 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FosP01101 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FosP01101 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FosP01101 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FosP01101 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FosP01101 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FosP01101 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FosP01101 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FosP01101 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FosP01101 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FosP01101 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FosP01101 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FosP01101 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FosP01101 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FosP01101 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FosP01101 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FosP01101 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FosP01101 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FosP01101 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FosP01101 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FosP01101 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FosP01101 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FosP01101 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FosP01101 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FosP01101 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FosP01101 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FosP01101 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FosP01101 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FosP01101 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FosP01101 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FosP01101 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FosP01101 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FosP01101 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FosP01101 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FosP01101 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FosP01101 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FosP01101 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FosP01101 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FosP01101 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FosP01101 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FosP01101 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FosP01101 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FosP01101 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FosP01101 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FosP01101 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FosP01101 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FosP01101 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FosP01101 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FosP01101 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FosP01101 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FosP01101 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FosP01101 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FosP01101 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FosP01101 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FosP01101 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FosP01101 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FosP01101 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FosP01101 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FosP01101 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FosP01101 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FosP01101 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FosP01101 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FosP01101 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FosP01101 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FosP01101 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FosP01101 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FosP01101 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FosP01101 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FosP01101 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FosP01101 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FosP01101 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FosP01101 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FosP01101 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FosP01101 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FosP01101 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FosP01101 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FosP01101 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FosP01101 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FosP01101 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FosP01101 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FosP01101 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FosP01101 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FosP01101 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FosP01101 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FosP01101 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FosP01101 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FosP01101 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FosP01101 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FosP01101 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FosP01101 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FosP01101 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FosP01101 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms