Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnmt3bO88509 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnmt3bO88509 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnmt3bO88509 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnmt3bO88509 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnmt3bO88509 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnmt3bO88509 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnmt3bO88509 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnmt3bO88509 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnmt3bO88509 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnmt3bO88509 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnmt3bO88509 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnmt3bO88509 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnmt3bO88509 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnmt3bO88509 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnmt3bO88509 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnmt3bO88509 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnmt3bO88509 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnmt3bO88509 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnmt3bO88509 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnmt3bO88509 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnmt3bO88509 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnmt3bO88509 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnmt3bO88509 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnmt3bO88509 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnmt3bO88509 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnmt3bO88509 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnmt3bO88509 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnmt3bO88509 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dnmt3bO88509 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Dnmt3bO88509 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Dnmt3bO88509 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 351.3 ms