Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pja1O55176 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pja1O55176 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pja1O55176 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pja1O55176 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pja1O55176 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pja1O55176 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pja1O55176 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pja1O55176 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pja1O55176 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pja1O55176 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pja1O55176 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pja1O55176 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pja1O55176 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pja1O55176 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pja1O55176 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pja1O55176 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pja1O55176 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pja1O55176 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pja1O55176 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pja1O55176 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pja1O55176 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pja1O55176 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pja1O55176 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pja1O55176 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pja1O55176 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pja1O55176 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pja1O55176 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pja1O55176 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pja1O55176 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pja1O55176 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pja1O55176 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pja1O55176 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pja1O55176 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pja1O55176 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pja1O55176 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pja1O55176 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pja1O55176 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pja1O55176 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pja1O55176 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pja1O55176 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pja1O55176 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pja1O55176 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pja1O55176 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pja1O55176 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pja1O55176 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pja1O55176 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pja1O55176 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pja1O55176 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pja1O55176 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pja1O55176 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pja1O55176 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pja1O55176 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pja1O55176 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pja1O55176 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pja1O55176 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms