Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dsg2O55111 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dsg2O55111 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Dsg2O55111 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dsg2O55111 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dsg2O55111 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dsg2O55111 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dsg2O55111 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dsg2O55111 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dsg2O55111 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dsg2O55111 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dsg2O55111 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dsg2O55111 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dsg2O55111 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dsg2O55111 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dsg2O55111 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dsg2O55111 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dsg2O55111 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dsg2O55111 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Dsg2O55111 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dsg2O55111 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dsg2O55111 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dsg2O55111 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dsg2O55111 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dsg2O55111 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dsg2O55111 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Dsg2O55111 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dsg2O55111 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dsg2O55111 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dsg2O55111 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dsg2O55111 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dsg2O55111 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dsg2O55111 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dsg2O55111 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dsg2O55111 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dsg2O55111 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dsg2O55111 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dsg2O55111 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dsg2O55111 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dsg2O55111 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms