Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2f6O54917 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2f6O54917 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2f6O54917 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2f6O54917 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2f6O54917 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2f6O54917 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
E2f6O54917 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2f6O54917 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2f6O54917 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2f6O54917 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
E2f6O54917 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2f6O54917 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2f6O54917 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2f6O54917 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
E2f6O54917 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2f6O54917 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2f6O54917 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2f6O54917 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2f6O54917 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2f6O54917 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2f6O54917 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2f6O54917 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2f6O54917 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2f6O54917 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2f6O54917 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2f6O54917 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2f6O54917 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2f6O54917 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2f6O54917 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2f6O54917 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2f6O54917 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2f6O54917 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
E2f6O54917 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2f6O54917 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2f6O54917 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
E2f6O54917 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2f6O54917 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2f6O54917 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
E2f6O54917 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2f6O54917 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2f6O54917 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms