Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TsksO54887 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TsksO54887 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TsksO54887 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TsksO54887 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TsksO54887 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TsksO54887 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TsksO54887 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TsksO54887 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TsksO54887 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TsksO54887 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TsksO54887 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TsksO54887 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TsksO54887 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TsksO54887 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TsksO54887 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TsksO54887 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TsksO54887 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TsksO54887 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TsksO54887 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TsksO54887 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TsksO54887 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TsksO54887 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TsksO54887 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TsksO54887 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TsksO54887 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TsksO54887 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TsksO54887 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TsksO54887 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TsksO54887 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TsksO54887 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TsksO54887 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TsksO54887 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TsksO54887 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TsksO54887 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TsksO54887 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TsksO54887 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TsksO54887 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TsksO54887 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TsksO54887 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TsksO54887 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TsksO54887 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TsksO54887 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TsksO54887 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TsksO54887 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TsksO54887 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TsksO54887 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TsksO54887 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TsksO54887 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TsksO54887 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TsksO54887 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TsksO54887 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TsksO54887 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TsksO54887 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TsksO54887 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TsksO54887 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TsksO54887 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TsksO54887 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TsksO54887 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TsksO54887 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TsksO54887 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TsksO54887 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TsksO54887 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TsksO54887 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TsksO54887 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TsksO54887 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TsksO54887 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TsksO54887 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TsksO54887 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TsksO54887 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TsksO54887 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TsksO54887 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TsksO54887 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TsksO54887 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TsksO54887 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TsksO54887 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TsksO54887 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TsksO54887 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TsksO54887 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TsksO54887 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TsksO54887 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TsksO54887 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TsksO54887 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TsksO54887 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TsksO54887 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TsksO54887 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TsksO54887 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TsksO54887 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TsksO54887 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TsksO54887 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TsksO54887 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TsksO54887 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TsksO54887 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TsksO54887 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TsksO54887 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TsksO54887 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TsksO54887 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TsksO54887 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TsksO54887 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TsksO54887 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms