Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Eftud2O08810 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Eftud2O08810 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Eftud2O08810 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Eftud2O08810 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Eftud2O08810 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Eftud2O08810 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Eftud2O08810 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Eftud2O08810 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Eftud2O08810 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Eftud2O08810 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Eftud2O08810 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Eftud2O08810 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Eftud2O08810 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Eftud2O08810 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Eftud2O08810 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Eftud2O08810 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Eftud2O08810 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eftud2O08810 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eftud2O08810 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eftud2O08810 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eftud2O08810 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eftud2O08810 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Eftud2O08810 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Eftud2O08810 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Eftud2O08810 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Eftud2O08810 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Eftud2O08810 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Eftud2O08810 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Eftud2O08810 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Eftud2O08810 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Eftud2O08810 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Eftud2O08810 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Eftud2O08810 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Eftud2O08810 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Eftud2O08810 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Eftud2O08810 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Eftud2O08810 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Eftud2O08810 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Eftud2O08810 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Eftud2O08810 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Eftud2O08810 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Eftud2O08810 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Eftud2O08810 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.1 ms