Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm8356J3QPD3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm8356J3QPD3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm8356J3QPD3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm8356J3QPD3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm8356J3QPD3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8356J3QPD3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8356J3QPD3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8356J3QPD3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8356J3QPD3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8356J3QPD3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8356J3QPD3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8356J3QPD3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8356J3QPD3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8356J3QPD3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8356J3QPD3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8356J3QPD3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8356J3QPD3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8356J3QPD3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8356J3QPD3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8356J3QPD3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8356J3QPD3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm8356J3QPD3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm8356J3QPD3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm8356J3QPD3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm8356J3QPD3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm8356J3QPD3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8356J3QPD3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8356J3QPD3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8356J3QPD3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8356J3QPD3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8356J3QPD3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8356J3QPD3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8356J3QPD3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8356J3QPD3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8356J3QPD3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8356J3QPD3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8356J3QPD3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms