Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20517G3UVU6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20517G3UVU6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20517G3UVU6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20517G3UVU6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20517G3UVU6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20517G3UVU6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20517G3UVU6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20517G3UVU6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20517G3UVU6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20517G3UVU6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20517G3UVU6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20517G3UVU6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20517G3UVU6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20517G3UVU6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20517G3UVU6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20517G3UVU6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20517G3UVU6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20517G3UVU6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20517G3UVU6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20517G3UVU6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20517G3UVU6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20517G3UVU6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20517G3UVU6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20517G3UVU6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20517G3UVU6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20517G3UVU6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20517G3UVU6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20517G3UVU6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20517G3UVU6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20517G3UVU6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20517G3UVU6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20517G3UVU6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20517G3UVU6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20517G3UVU6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20517G3UVU6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20517G3UVU6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20517G3UVU6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20517G3UVU6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20517G3UVU6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20517G3UVU6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20517G3UVU6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20517G3UVU6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20517G3UVU6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20517G3UVU6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20517G3UVU6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20517G3UVU6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20517G3UVU6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20517G3UVU6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20517G3UVU6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20517G3UVU6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms