Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Ercc6F8VPZ5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Ercc6F8VPZ5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Ercc6F8VPZ5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Ercc6F8VPZ5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Ercc6F8VPZ5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
Ercc6F8VPZ5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Ercc6F8VPZ5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
Ercc6F8VPZ5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Ercc6F8VPZ5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Ercc6F8VPZ5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Ercc6F8VPZ5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Ercc6F8VPZ5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Ercc6F8VPZ5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Ercc6F8VPZ5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Ercc6F8VPZ5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Ercc6F8VPZ5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Ercc6F8VPZ5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Ercc6F8VPZ5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Ercc6F8VPZ5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Ercc6F8VPZ5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
Ercc6F8VPZ5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Ercc6F8VPZ5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Ercc6F8VPZ5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Ercc6F8VPZ5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Ercc6F8VPZ5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Ercc6F8VPZ5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Ercc6F8VPZ5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Ercc6F8VPZ5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Ercc6F8VPZ5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Ercc6F8VPZ5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Ercc6F8VPZ5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Ercc6F8VPZ5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Ercc6F8VPZ5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Ercc6F8VPZ5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Ercc6F8VPZ5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ercc6F8VPZ5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
Ercc6F8VPZ5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ercc6F8VPZ5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ercc6F8VPZ5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ercc6F8VPZ5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ercc6F8VPZ5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ercc6F8VPZ5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ercc6F8VPZ5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ercc6F8VPZ5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
Ercc6F8VPZ5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
Ercc6F8VPZ5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC37.76■■■■□ 3.63
Ercc6F8VPZ5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Ercc6F8VPZ5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Ercc6F8VPZ5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Ercc6F8VPZ5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
Ercc6F8VPZ5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Ercc6F8VPZ5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Ercc6F8VPZ5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Ercc6F8VPZ5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Ercc6F8VPZ5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Ercc6F8VPZ5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Ercc6F8VPZ5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Ercc6F8VPZ5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Ercc6F8VPZ5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Ercc6F8VPZ5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Ercc6F8VPZ5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Ercc6F8VPZ5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Ercc6F8VPZ5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Ercc6F8VPZ5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Ercc6F8VPZ5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Ercc6F8VPZ5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Ercc6F8VPZ5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
Ercc6F8VPZ5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Ercc6F8VPZ5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Ercc6F8VPZ5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Ercc6F8VPZ5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Ercc6F8VPZ5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Ercc6F8VPZ5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
Ercc6F8VPZ5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
Ercc6F8VPZ5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Ercc6F8VPZ5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Ercc6F8VPZ5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Ercc6F8VPZ5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Ercc6F8VPZ5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Ercc6F8VPZ5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Ercc6F8VPZ5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Ercc6F8VPZ5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Ercc6F8VPZ5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Ercc6F8VPZ5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Ercc6F8VPZ5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Ercc6F8VPZ5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Ercc6F8VPZ5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
Ercc6F8VPZ5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
Ercc6F8VPZ5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Ercc6F8VPZ5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Ercc6F8VPZ5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Ercc6F8VPZ5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Ercc6F8VPZ5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Ercc6F8VPZ5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Ercc6F8VPZ5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Ercc6F8VPZ5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Ercc6F8VPZ5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Ercc6F8VPZ5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Ercc6F8VPZ5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms