Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vpreb3D3Z6J4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1681 ms