Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
3425401B19RikD3Z1D3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
3425401B19RikD3Z1D3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
3425401B19RikD3Z1D3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
3425401B19RikD3Z1D3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
3425401B19RikD3Z1D3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
3425401B19RikD3Z1D3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
3425401B19RikD3Z1D3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
3425401B19RikD3Z1D3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
3425401B19RikD3Z1D3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
3425401B19RikD3Z1D3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
3425401B19RikD3Z1D3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
3425401B19RikD3Z1D3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
3425401B19RikD3Z1D3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
3425401B19RikD3Z1D3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
3425401B19RikD3Z1D3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
3425401B19RikD3Z1D3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
3425401B19RikD3Z1D3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
3425401B19RikD3Z1D3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
3425401B19RikD3Z1D3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
3425401B19RikD3Z1D3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
3425401B19RikD3Z1D3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
3425401B19RikD3Z1D3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
3425401B19RikD3Z1D3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
3425401B19RikD3Z1D3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
3425401B19RikD3Z1D3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC32.07■■■□□ 2.73
3425401B19RikD3Z1D3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
3425401B19RikD3Z1D3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
3425401B19RikD3Z1D3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
3425401B19RikD3Z1D3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
3425401B19RikD3Z1D3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
3425401B19RikD3Z1D3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
3425401B19RikD3Z1D3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
3425401B19RikD3Z1D3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
3425401B19RikD3Z1D3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
3425401B19RikD3Z1D3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
3425401B19RikD3Z1D3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
3425401B19RikD3Z1D3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
3425401B19RikD3Z1D3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
3425401B19RikD3Z1D3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
3425401B19RikD3Z1D3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
3425401B19RikD3Z1D3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
3425401B19RikD3Z1D3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
3425401B19RikD3Z1D3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
3425401B19RikD3Z1D3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
3425401B19RikD3Z1D3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
3425401B19RikD3Z1D3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
3425401B19RikD3Z1D3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
3425401B19RikD3Z1D3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
3425401B19RikD3Z1D3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
3425401B19RikD3Z1D3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
3425401B19RikD3Z1D3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
3425401B19RikD3Z1D3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
3425401B19RikD3Z1D3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
3425401B19RikD3Z1D3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
3425401B19RikD3Z1D3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
3425401B19RikD3Z1D3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC32■■■□□ 2.71
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
3425401B19RikD3Z1D3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
3425401B19RikD3Z1D3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
3425401B19RikD3Z1D3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
3425401B19RikD3Z1D3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
3425401B19RikD3Z1D3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
3425401B19RikD3Z1D3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
3425401B19RikD3Z1D3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
3425401B19RikD3Z1D3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
3425401B19RikD3Z1D3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
3425401B19RikD3Z1D3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
3425401B19RikD3Z1D3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
3425401B19RikD3Z1D3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
3425401B19RikD3Z1D3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
3425401B19RikD3Z1D3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
3425401B19RikD3Z1D3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
3425401B19RikD3Z1D3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
3425401B19RikD3Z1D3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
3425401B19RikD3Z1D3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
3425401B19RikD3Z1D3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
3425401B19RikD3Z1D3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
3425401B19RikD3Z1D3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
3425401B19RikD3Z1D3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
3425401B19RikD3Z1D3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
3425401B19RikD3Z1D3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
3425401B19RikD3Z1D3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
3425401B19RikD3Z1D3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
3425401B19RikD3Z1D3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
3425401B19RikD3Z1D3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
3425401B19RikD3Z1D3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
3425401B19RikD3Z1D3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
3425401B19RikD3Z1D3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
3425401B19RikD3Z1D3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
3425401B19RikD3Z1D3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
3425401B19RikD3Z1D3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
3425401B19RikD3Z1D3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
3425401B19RikD3Z1D3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
3425401B19RikD3Z1D3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
3425401B19RikD3Z1D3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms