Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ythdc2B2RR83 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ythdc2B2RR83 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ythdc2B2RR83 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ythdc2B2RR83 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Ythdc2B2RR83 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ythdc2B2RR83 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ythdc2B2RR83 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ythdc2B2RR83 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ythdc2B2RR83 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ythdc2B2RR83 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ythdc2B2RR83 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ythdc2B2RR83 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ythdc2B2RR83 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Ythdc2B2RR83 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
Ythdc2B2RR83 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Ythdc2B2RR83 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ythdc2B2RR83 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ythdc2B2RR83 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ythdc2B2RR83 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ythdc2B2RR83 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ythdc2B2RR83 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ythdc2B2RR83 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ythdc2B2RR83 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ythdc2B2RR83 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ythdc2B2RR83 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ythdc2B2RR83 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ythdc2B2RR83 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ythdc2B2RR83 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ythdc2B2RR83 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ythdc2B2RR83 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Ythdc2B2RR83 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ythdc2B2RR83 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ythdc2B2RR83 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Ythdc2B2RR83 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Ythdc2B2RR83 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ythdc2B2RR83 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ythdc2B2RR83 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ythdc2B2RR83 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ythdc2B2RR83 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ythdc2B2RR83 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ythdc2B2RR83 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ythdc2B2RR83 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ythdc2B2RR83 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Ythdc2B2RR83 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ythdc2B2RR83 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ythdc2B2RR83 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ythdc2B2RR83 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ythdc2B2RR83 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ythdc2B2RR83 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ythdc2B2RR83 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ythdc2B2RR83 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ythdc2B2RR83 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ythdc2B2RR83 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ythdc2B2RR83 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Ythdc2B2RR83 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ythdc2B2RR83 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ythdc2B2RR83 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ythdc2B2RR83 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Ythdc2B2RR83 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ythdc2B2RR83 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ythdc2B2RR83 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ythdc2B2RR83 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ythdc2B2RR83 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Ythdc2B2RR83 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ythdc2B2RR83 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ythdc2B2RR83 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ythdc2B2RR83 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ythdc2B2RR83 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ythdc2B2RR83 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ythdc2B2RR83 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ythdc2B2RR83 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ythdc2B2RR83 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Ythdc2B2RR83 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Ythdc2B2RR83 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
Ythdc2B2RR83 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Ythdc2B2RR83 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ythdc2B2RR83 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ythdc2B2RR83 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ythdc2B2RR83 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Ythdc2B2RR83 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ythdc2B2RR83 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ythdc2B2RR83 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ythdc2B2RR83 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ythdc2B2RR83 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ythdc2B2RR83 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ythdc2B2RR83 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ythdc2B2RR83 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ythdc2B2RR83 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ythdc2B2RR83 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ythdc2B2RR83 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ythdc2B2RR83 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Ythdc2B2RR83 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ythdc2B2RR83 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ythdc2B2RR83 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ythdc2B2RR83 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ythdc2B2RR83 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ythdc2B2RR83 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ythdc2B2RR83 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ythdc2B2RR83 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms