Protein–RNA interactions for Protein: A7L9Z8

Atp2c2, Calcium-transporting ATPase type 2C member 2, mousemouse

Predictions only

Length 944 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2c2A7L9Z8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2c2A7L9Z8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp2c2A7L9Z8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp2c2A7L9Z8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp2c2A7L9Z8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp2c2A7L9Z8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp2c2A7L9Z8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp2c2A7L9Z8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp2c2A7L9Z8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp2c2A7L9Z8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2c2A7L9Z8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2c2A7L9Z8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2c2A7L9Z8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2c2A7L9Z8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2c2A7L9Z8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2c2A7L9Z8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2c2A7L9Z8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2c2A7L9Z8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2c2A7L9Z8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2c2A7L9Z8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2c2A7L9Z8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2c2A7L9Z8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2c2A7L9Z8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2c2A7L9Z8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2c2A7L9Z8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2c2A7L9Z8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2c2A7L9Z8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2c2A7L9Z8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2c2A7L9Z8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2c2A7L9Z8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2c2A7L9Z8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2c2A7L9Z8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2c2A7L9Z8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2c2A7L9Z8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2c2A7L9Z8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2c2A7L9Z8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp2c2A7L9Z8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp2c2A7L9Z8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp2c2A7L9Z8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp2c2A7L9Z8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp2c2A7L9Z8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp2c2A7L9Z8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms