Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Plcb2A3KGF7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Plcb2A3KGF7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Plcb2A3KGF7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Plcb2A3KGF7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Plcb2A3KGF7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Plcb2A3KGF7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Plcb2A3KGF7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Plcb2A3KGF7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Plcb2A3KGF7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Plcb2A3KGF7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Plcb2A3KGF7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Plcb2A3KGF7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Plcb2A3KGF7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Plcb2A3KGF7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Plcb2A3KGF7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Plcb2A3KGF7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Plcb2A3KGF7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Plcb2A3KGF7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Plcb2A3KGF7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Plcb2A3KGF7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Plcb2A3KGF7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Plcb2A3KGF7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Plcb2A3KGF7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Plcb2A3KGF7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Plcb2A3KGF7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Plcb2A3KGF7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Plcb2A3KGF7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Plcb2A3KGF7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Plcb2A3KGF7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Plcb2A3KGF7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Plcb2A3KGF7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Plcb2A3KGF7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Plcb2A3KGF7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Plcb2A3KGF7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Plcb2A3KGF7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Plcb2A3KGF7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Plcb2A3KGF7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Plcb2A3KGF7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Plcb2A3KGF7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Plcb2A3KGF7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Plcb2A3KGF7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Plcb2A3KGF7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Plcb2A3KGF7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Plcb2A3KGF7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Plcb2A3KGF7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Plcb2A3KGF7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Plcb2A3KGF7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Plcb2A3KGF7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Plcb2A3KGF7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Plcb2A3KGF7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Plcb2A3KGF7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Plcb2A3KGF7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Plcb2A3KGF7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Plcb2A3KGF7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Plcb2A3KGF7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Plcb2A3KGF7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Plcb2A3KGF7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Plcb2A3KGF7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Plcb2A3KGF7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Plcb2A3KGF7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Plcb2A3KGF7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Plcb2A3KGF7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Plcb2A3KGF7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Plcb2A3KGF7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Plcb2A3KGF7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Plcb2A3KGF7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Plcb2A3KGF7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Plcb2A3KGF7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Plcb2A3KGF7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Plcb2A3KGF7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Plcb2A3KGF7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Plcb2A3KGF7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Plcb2A3KGF7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Plcb2A3KGF7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Plcb2A3KGF7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Plcb2A3KGF7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Plcb2A3KGF7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Plcb2A3KGF7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Plcb2A3KGF7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Plcb2A3KGF7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Plcb2A3KGF7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Plcb2A3KGF7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Plcb2A3KGF7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Plcb2A3KGF7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Plcb2A3KGF7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Plcb2A3KGF7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Plcb2A3KGF7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Plcb2A3KGF7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Plcb2A3KGF7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Plcb2A3KGF7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Plcb2A3KGF7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Plcb2A3KGF7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Plcb2A3KGF7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Plcb2A3KGF7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Plcb2A3KGF7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Plcb2A3KGF7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Plcb2A3KGF7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Plcb2A3KGF7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Plcb2A3KGF7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms