Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930447F04RikA2AFR2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms