Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5C7

Znf728, Zinc finger protein 728, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf728Q6P5C7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf728Q6P5C7 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms