Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5C7

Znf728, Zinc finger protein 728, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf728Q6P5C7 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf728Q6P5C7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms