Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tsc22d3Q9Z2S7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tsc22d3Q9Z2S7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tsc22d3Q9Z2S7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tsc22d3Q9Z2S7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tsc22d3Q9Z2S7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tsc22d3Q9Z2S7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tsc22d3Q9Z2S7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tsc22d3Q9Z2S7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tsc22d3Q9Z2S7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsc22d3Q9Z2S7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsc22d3Q9Z2S7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsc22d3Q9Z2S7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsc22d3Q9Z2S7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsc22d3Q9Z2S7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsc22d3Q9Z2S7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsc22d3Q9Z2S7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tsc22d3Q9Z2S7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tsc22d3Q9Z2S7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tsc22d3Q9Z2S7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tsc22d3Q9Z2S7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tsc22d3Q9Z2S7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tsc22d3Q9Z2S7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tsc22d3Q9Z2S7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tsc22d3Q9Z2S7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tsc22d3Q9Z2S7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tsc22d3Q9Z2S7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tsc22d3Q9Z2S7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tsc22d3Q9Z2S7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tsc22d3Q9Z2S7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tsc22d3Q9Z2S7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tsc22d3Q9Z2S7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tsc22d3Q9Z2S7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tsc22d3Q9Z2S7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tsc22d3Q9Z2S7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tsc22d3Q9Z2S7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tsc22d3Q9Z2S7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tsc22d3Q9Z2S7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms