Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Mbd3Q9Z2D8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mbd3Q9Z2D8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mbd3Q9Z2D8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mbd3Q9Z2D8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mbd3Q9Z2D8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mbd3Q9Z2D8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mbd3Q9Z2D8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mbd3Q9Z2D8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mbd3Q9Z2D8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mbd3Q9Z2D8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mbd3Q9Z2D8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mbd3Q9Z2D8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mbd3Q9Z2D8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mbd3Q9Z2D8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mbd3Q9Z2D8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mbd3Q9Z2D8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mbd3Q9Z2D8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mbd3Q9Z2D8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mbd3Q9Z2D8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mbd3Q9Z2D8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mbd3Q9Z2D8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mbd3Q9Z2D8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mbd3Q9Z2D8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mbd3Q9Z2D8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mbd3Q9Z2D8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mbd3Q9Z2D8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mbd3Q9Z2D8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Mbd3Q9Z2D8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mbd3Q9Z2D8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mbd3Q9Z2D8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mbd3Q9Z2D8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mbd3Q9Z2D8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mbd3Q9Z2D8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mbd3Q9Z2D8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mbd3Q9Z2D8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mbd3Q9Z2D8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mbd3Q9Z2D8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mbd3Q9Z2D8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mbd3Q9Z2D8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mbd3Q9Z2D8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mbd3Q9Z2D8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mbd3Q9Z2D8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mbd3Q9Z2D8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Mbd3Q9Z2D8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mbd3Q9Z2D8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Mbd3Q9Z2D8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Mbd3Q9Z2D8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Mbd3Q9Z2D8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Mbd3Q9Z2D8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Mbd3Q9Z2D8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mbd3Q9Z2D8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mbd3Q9Z2D8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mbd3Q9Z2D8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mbd3Q9Z2D8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Mbd3Q9Z2D8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mbd3Q9Z2D8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Mbd3Q9Z2D8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Mbd3Q9Z2D8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Mbd3Q9Z2D8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Mbd3Q9Z2D8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Mbd3Q9Z2D8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Mbd3Q9Z2D8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Mbd3Q9Z2D8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Mbd3Q9Z2D8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Mbd3Q9Z2D8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mbd3Q9Z2D8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mbd3Q9Z2D8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mbd3Q9Z2D8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mbd3Q9Z2D8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mbd3Q9Z2D8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mbd3Q9Z2D8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mbd3Q9Z2D8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mbd3Q9Z2D8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mbd3Q9Z2D8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mbd3Q9Z2D8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Mbd3Q9Z2D8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Mbd3Q9Z2D8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Mbd3Q9Z2D8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mbd3Q9Z2D8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Mbd3Q9Z2D8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Mbd3Q9Z2D8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Mbd3Q9Z2D8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Mbd3Q9Z2D8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Mbd3Q9Z2D8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Mbd3Q9Z2D8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Mbd3Q9Z2D8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Mbd3Q9Z2D8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Mbd3Q9Z2D8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Mbd3Q9Z2D8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Mbd3Q9Z2D8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Mbd3Q9Z2D8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Mbd3Q9Z2D8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Mbd3Q9Z2D8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mbd3Q9Z2D8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mbd3Q9Z2D8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mbd3Q9Z2D8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms