Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shcbp1Q9Z179 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shcbp1Q9Z179 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shcbp1Q9Z179 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Shcbp1Q9Z179 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shcbp1Q9Z179 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shcbp1Q9Z179 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shcbp1Q9Z179 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shcbp1Q9Z179 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shcbp1Q9Z179 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shcbp1Q9Z179 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shcbp1Q9Z179 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shcbp1Q9Z179 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shcbp1Q9Z179 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shcbp1Q9Z179 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shcbp1Q9Z179 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shcbp1Q9Z179 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shcbp1Q9Z179 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shcbp1Q9Z179 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shcbp1Q9Z179 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shcbp1Q9Z179 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shcbp1Q9Z179 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shcbp1Q9Z179 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Shcbp1Q9Z179 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Shcbp1Q9Z179 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shcbp1Q9Z179 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shcbp1Q9Z179 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shcbp1Q9Z179 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shcbp1Q9Z179 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shcbp1Q9Z179 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shcbp1Q9Z179 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shcbp1Q9Z179 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shcbp1Q9Z179 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shcbp1Q9Z179 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shcbp1Q9Z179 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shcbp1Q9Z179 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shcbp1Q9Z179 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shcbp1Q9Z179 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shcbp1Q9Z179 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shcbp1Q9Z179 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shcbp1Q9Z179 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shcbp1Q9Z179 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.3■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Shcbp1Q9Z179 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Shcbp1Q9Z179 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Shcbp1Q9Z179 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Shcbp1Q9Z179 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Shcbp1Q9Z179 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Shcbp1Q9Z179 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Shcbp1Q9Z179 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Shcbp1Q9Z179 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Shcbp1Q9Z179 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Shcbp1Q9Z179 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms