Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmed2Q9R0Q3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmed2Q9R0Q3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmed2Q9R0Q3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmed2Q9R0Q3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmed2Q9R0Q3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmed2Q9R0Q3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmed2Q9R0Q3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmed2Q9R0Q3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmed2Q9R0Q3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmed2Q9R0Q3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmed2Q9R0Q3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmed2Q9R0Q3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmed2Q9R0Q3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmed2Q9R0Q3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmed2Q9R0Q3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmed2Q9R0Q3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmed2Q9R0Q3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmed2Q9R0Q3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmed2Q9R0Q3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmed2Q9R0Q3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmed2Q9R0Q3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmed2Q9R0Q3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmed2Q9R0Q3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmed2Q9R0Q3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmed2Q9R0Q3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmed2Q9R0Q3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmed2Q9R0Q3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmed2Q9R0Q3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmed2Q9R0Q3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmed2Q9R0Q3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmed2Q9R0Q3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmed2Q9R0Q3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmed2Q9R0Q3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmed2Q9R0Q3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmed2Q9R0Q3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmed2Q9R0Q3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmed2Q9R0Q3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmed2Q9R0Q3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmed2Q9R0Q3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmed2Q9R0Q3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmed2Q9R0Q3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmed2Q9R0Q3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmed2Q9R0Q3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmed2Q9R0Q3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmed2Q9R0Q3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmed2Q9R0Q3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmed2Q9R0Q3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmed2Q9R0Q3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmed2Q9R0Q3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmed2Q9R0Q3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmed2Q9R0Q3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmed2Q9R0Q3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmed2Q9R0Q3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmed2Q9R0Q3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms