Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L1

Hsf4, Heat shock factor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsf4Q9R0L1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hsf4Q9R0L1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hsf4Q9R0L1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hsf4Q9R0L1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hsf4Q9R0L1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hsf4Q9R0L1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hsf4Q9R0L1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hsf4Q9R0L1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hsf4Q9R0L1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hsf4Q9R0L1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hsf4Q9R0L1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hsf4Q9R0L1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hsf4Q9R0L1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hsf4Q9R0L1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hsf4Q9R0L1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hsf4Q9R0L1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hsf4Q9R0L1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Hsf4Q9R0L1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hsf4Q9R0L1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hsf4Q9R0L1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hsf4Q9R0L1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hsf4Q9R0L1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hsf4Q9R0L1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Hsf4Q9R0L1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hsf4Q9R0L1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hsf4Q9R0L1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hsf4Q9R0L1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Hsf4Q9R0L1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hsf4Q9R0L1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hsf4Q9R0L1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hsf4Q9R0L1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hsf4Q9R0L1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hsf4Q9R0L1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hsf4Q9R0L1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Hsf4Q9R0L1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Hsf4Q9R0L1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hsf4Q9R0L1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hsf4Q9R0L1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hsf4Q9R0L1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hsf4Q9R0L1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hsf4Q9R0L1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hsf4Q9R0L1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hsf4Q9R0L1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hsf4Q9R0L1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hsf4Q9R0L1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104 ms