Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms