Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VapbQ9QY76 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VapbQ9QY76 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VapbQ9QY76 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VapbQ9QY76 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VapbQ9QY76 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VapbQ9QY76 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VapbQ9QY76 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VapbQ9QY76 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VapbQ9QY76 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VapbQ9QY76 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VapbQ9QY76 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VapbQ9QY76 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VapbQ9QY76 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VapbQ9QY76 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
VapbQ9QY76 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VapbQ9QY76 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VapbQ9QY76 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
VapbQ9QY76 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VapbQ9QY76 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VapbQ9QY76 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VapbQ9QY76 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VapbQ9QY76 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VapbQ9QY76 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VapbQ9QY76 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VapbQ9QY76 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VapbQ9QY76 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VapbQ9QY76 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VapbQ9QY76 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VapbQ9QY76 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VapbQ9QY76 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VapbQ9QY76 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VapbQ9QY76 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VapbQ9QY76 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VapbQ9QY76 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VapbQ9QY76 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VapbQ9QY76 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VapbQ9QY76 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VapbQ9QY76 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VapbQ9QY76 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VapbQ9QY76 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VapbQ9QY76 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VapbQ9QY76 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VapbQ9QY76 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VapbQ9QY76 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VapbQ9QY76 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VapbQ9QY76 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VapbQ9QY76 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VapbQ9QY76 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VapbQ9QY76 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VapbQ9QY76 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VapbQ9QY76 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VapbQ9QY76 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VapbQ9QY76 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms