Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lsm4Q9QXA5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms