Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM4

Slamf1, Signaling lymphocytic activation molecule, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slamf1Q9QUM4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Slamf1Q9QUM4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slamf1Q9QUM4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slamf1Q9QUM4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slamf1Q9QUM4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slamf1Q9QUM4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slamf1Q9QUM4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slamf1Q9QUM4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Slamf1Q9QUM4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slamf1Q9QUM4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slamf1Q9QUM4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slamf1Q9QUM4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slamf1Q9QUM4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slamf1Q9QUM4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slamf1Q9QUM4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slamf1Q9QUM4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slamf1Q9QUM4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slamf1Q9QUM4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slamf1Q9QUM4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms