Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tnfrsf19Q9JLL3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfrsf19Q9JLL3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfrsf19Q9JLL3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfrsf19Q9JLL3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms