Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnga3Q9JJZ8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnga3Q9JJZ8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnga3Q9JJZ8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnga3Q9JJZ8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnga3Q9JJZ8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnga3Q9JJZ8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnga3Q9JJZ8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnga3Q9JJZ8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnga3Q9JJZ8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnga3Q9JJZ8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnga3Q9JJZ8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnga3Q9JJZ8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnga3Q9JJZ8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnga3Q9JJZ8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnga3Q9JJZ8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnga3Q9JJZ8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnga3Q9JJZ8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnga3Q9JJZ8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnga3Q9JJZ8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnga3Q9JJZ8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnga3Q9JJZ8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnga3Q9JJZ8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnga3Q9JJZ8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnga3Q9JJZ8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnga3Q9JJZ8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnga3Q9JJZ8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnga3Q9JJZ8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnga3Q9JJZ8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnga3Q9JJZ8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnga3Q9JJZ8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnga3Q9JJZ8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnga3Q9JJZ8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnga3Q9JJZ8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnga3Q9JJZ8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
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