Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OtofQ9ESF1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
OtofQ9ESF1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OtofQ9ESF1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OtofQ9ESF1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OtofQ9ESF1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OtofQ9ESF1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OtofQ9ESF1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OtofQ9ESF1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OtofQ9ESF1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OtofQ9ESF1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OtofQ9ESF1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OtofQ9ESF1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OtofQ9ESF1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OtofQ9ESF1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OtofQ9ESF1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OtofQ9ESF1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OtofQ9ESF1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OtofQ9ESF1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OtofQ9ESF1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OtofQ9ESF1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OtofQ9ESF1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OtofQ9ESF1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OtofQ9ESF1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OtofQ9ESF1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OtofQ9ESF1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OtofQ9ESF1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OtofQ9ESF1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OtofQ9ESF1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OtofQ9ESF1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OtofQ9ESF1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OtofQ9ESF1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OtofQ9ESF1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OtofQ9ESF1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OtofQ9ESF1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OtofQ9ESF1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
OtofQ9ESF1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OtofQ9ESF1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OtofQ9ESF1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OtofQ9ESF1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
OtofQ9ESF1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OtofQ9ESF1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OtofQ9ESF1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OtofQ9ESF1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OtofQ9ESF1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
OtofQ9ESF1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
OtofQ9ESF1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OtofQ9ESF1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OtofQ9ESF1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OtofQ9ESF1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OtofQ9ESF1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OtofQ9ESF1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OtofQ9ESF1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OtofQ9ESF1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OtofQ9ESF1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OtofQ9ESF1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OtofQ9ESF1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
OtofQ9ESF1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OtofQ9ESF1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OtofQ9ESF1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OtofQ9ESF1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OtofQ9ESF1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OtofQ9ESF1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OtofQ9ESF1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OtofQ9ESF1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OtofQ9ESF1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OtofQ9ESF1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms