Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Irx6Q9ER75 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Irx6Q9ER75 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Irx6Q9ER75 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Irx6Q9ER75 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Irx6Q9ER75 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Irx6Q9ER75 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Irx6Q9ER75 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Irx6Q9ER75 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Irx6Q9ER75 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Irx6Q9ER75 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Irx6Q9ER75 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Irx6Q9ER75 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Irx6Q9ER75 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Irx6Q9ER75 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Irx6Q9ER75 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Irx6Q9ER75 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Irx6Q9ER75 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Irx6Q9ER75 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Irx6Q9ER75 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Irx6Q9ER75 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Irx6Q9ER75 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Irx6Q9ER75 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Irx6Q9ER75 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Irx6Q9ER75 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Irx6Q9ER75 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Irx6Q9ER75 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Irx6Q9ER75 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Irx6Q9ER75 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Irx6Q9ER75 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Irx6Q9ER75 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Irx6Q9ER75 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Irx6Q9ER75 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Irx6Q9ER75 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Irx6Q9ER75 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Irx6Q9ER75 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Irx6Q9ER75 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Irx6Q9ER75 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Irx6Q9ER75 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Irx6Q9ER75 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Irx6Q9ER75 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Irx6Q9ER75 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Irx6Q9ER75 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Irx6Q9ER75 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Irx6Q9ER75 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Irx6Q9ER75 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Irx6Q9ER75 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Irx6Q9ER75 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Irx6Q9ER75 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Irx6Q9ER75 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Irx6Q9ER75 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Irx6Q9ER75 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Irx6Q9ER75 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Irx6Q9ER75 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Irx6Q9ER75 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Irx6Q9ER75 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Irx6Q9ER75 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Irx6Q9ER75 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Irx6Q9ER75 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Irx6Q9ER75 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Irx6Q9ER75 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Irx6Q9ER75 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Irx6Q9ER75 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Irx6Q9ER75 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Irx6Q9ER75 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Irx6Q9ER75 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Irx6Q9ER75 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Irx6Q9ER75 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Irx6Q9ER75 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Irx6Q9ER75 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Irx6Q9ER75 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Irx6Q9ER75 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Irx6Q9ER75 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Irx6Q9ER75 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Irx6Q9ER75 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Irx6Q9ER75 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Irx6Q9ER75 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Irx6Q9ER75 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Irx6Q9ER75 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Irx6Q9ER75 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Irx6Q9ER75 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Irx6Q9ER75 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Irx6Q9ER75 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Irx6Q9ER75 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Irx6Q9ER75 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Irx6Q9ER75 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Irx6Q9ER75 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Irx6Q9ER75 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Irx6Q9ER75 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Irx6Q9ER75 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Irx6Q9ER75 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Irx6Q9ER75 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Irx6Q9ER75 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Irx6Q9ER75 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Irx6Q9ER75 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Irx6Q9ER75 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Irx6Q9ER75 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Irx6Q9ER75 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Irx6Q9ER75 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Irx6Q9ER75 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms