Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpr88Q9EPB7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpr88Q9EPB7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gpr88Q9EPB7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gpr88Q9EPB7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpr88Q9EPB7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpr88Q9EPB7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpr88Q9EPB7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpr88Q9EPB7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms