Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT6

Bap18, Chromatin complexes subunit BAP18, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap18Q9DCT6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bap18Q9DCT6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bap18Q9DCT6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bap18Q9DCT6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bap18Q9DCT6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bap18Q9DCT6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bap18Q9DCT6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bap18Q9DCT6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bap18Q9DCT6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bap18Q9DCT6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bap18Q9DCT6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bap18Q9DCT6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bap18Q9DCT6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bap18Q9DCT6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bap18Q9DCT6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bap18Q9DCT6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bap18Q9DCT6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Bap18Q9DCT6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bap18Q9DCT6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bap18Q9DCT6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bap18Q9DCT6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bap18Q9DCT6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Bap18Q9DCT6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bap18Q9DCT6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Bap18Q9DCT6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bap18Q9DCT6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bap18Q9DCT6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bap18Q9DCT6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bap18Q9DCT6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Bap18Q9DCT6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Bap18Q9DCT6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bap18Q9DCT6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bap18Q9DCT6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bap18Q9DCT6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bap18Q9DCT6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bap18Q9DCT6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bap18Q9DCT6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bap18Q9DCT6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bap18Q9DCT6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bap18Q9DCT6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bap18Q9DCT6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bap18Q9DCT6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bap18Q9DCT6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bap18Q9DCT6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bap18Q9DCT6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Bap18Q9DCT6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bap18Q9DCT6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bap18Q9DCT6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bap18Q9DCT6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bap18Q9DCT6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bap18Q9DCT6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bap18Q9DCT6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bap18Q9DCT6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Bap18Q9DCT6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bap18Q9DCT6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bap18Q9DCT6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bap18Q9DCT6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bap18Q9DCT6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bap18Q9DCT6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms