Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tmem239Q9DA47 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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Tmem239Q9DA47 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem239Q9DA47 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms