Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sgf29Q9DA08 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sgf29Q9DA08 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sgf29Q9DA08 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sgf29Q9DA08 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sgf29Q9DA08 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms