Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Alkbh4Q9D8F1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Alkbh4Q9D8F1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Alkbh4Q9D8F1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Alkbh4Q9D8F1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Alkbh4Q9D8F1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Alkbh4Q9D8F1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Alkbh4Q9D8F1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Alkbh4Q9D8F1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Alkbh4Q9D8F1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Alkbh4Q9D8F1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Alkbh4Q9D8F1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Alkbh4Q9D8F1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Alkbh4Q9D8F1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms