Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D1

Rnf225, RING finger protein 225, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf225Q9D7D1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf225Q9D7D1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf225Q9D7D1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf225Q9D7D1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf225Q9D7D1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf225Q9D7D1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf225Q9D7D1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf225Q9D7D1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf225Q9D7D1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf225Q9D7D1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf225Q9D7D1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf225Q9D7D1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf225Q9D7D1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rnf225Q9D7D1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf225Q9D7D1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf225Q9D7D1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf225Q9D7D1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf225Q9D7D1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf225Q9D7D1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf225Q9D7D1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf225Q9D7D1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf225Q9D7D1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf225Q9D7D1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf225Q9D7D1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf225Q9D7D1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf225Q9D7D1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf225Q9D7D1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf225Q9D7D1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf225Q9D7D1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf225Q9D7D1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf225Q9D7D1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf225Q9D7D1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf225Q9D7D1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf225Q9D7D1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf225Q9D7D1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf225Q9D7D1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf225Q9D7D1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf225Q9D7D1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf225Q9D7D1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf225Q9D7D1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf225Q9D7D1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf225Q9D7D1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf225Q9D7D1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf225Q9D7D1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf225Q9D7D1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf225Q9D7D1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf225Q9D7D1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf225Q9D7D1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf225Q9D7D1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf225Q9D7D1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf225Q9D7D1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf225Q9D7D1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf225Q9D7D1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Rnf225Q9D7D1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf225Q9D7D1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf225Q9D7D1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf225Q9D7D1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf225Q9D7D1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf225Q9D7D1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf225Q9D7D1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf225Q9D7D1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf225Q9D7D1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf225Q9D7D1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf225Q9D7D1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf225Q9D7D1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf225Q9D7D1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf225Q9D7D1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf225Q9D7D1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf225Q9D7D1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf225Q9D7D1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf225Q9D7D1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf225Q9D7D1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf225Q9D7D1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf225Q9D7D1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf225Q9D7D1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf225Q9D7D1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf225Q9D7D1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf225Q9D7D1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf225Q9D7D1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf225Q9D7D1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf225Q9D7D1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf225Q9D7D1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf225Q9D7D1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf225Q9D7D1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf225Q9D7D1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf225Q9D7D1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf225Q9D7D1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf225Q9D7D1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf225Q9D7D1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf225Q9D7D1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf225Q9D7D1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf225Q9D7D1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf225Q9D7D1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf225Q9D7D1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf225Q9D7D1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf225Q9D7D1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf225Q9D7D1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf225Q9D7D1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf225Q9D7D1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf225Q9D7D1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms