Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tube1Q9D6T1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tube1Q9D6T1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tube1Q9D6T1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tube1Q9D6T1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tube1Q9D6T1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tube1Q9D6T1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tube1Q9D6T1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tube1Q9D6T1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tube1Q9D6T1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tube1Q9D6T1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tube1Q9D6T1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tube1Q9D6T1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tube1Q9D6T1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tube1Q9D6T1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tube1Q9D6T1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tube1Q9D6T1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Tube1Q9D6T1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tube1Q9D6T1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tube1Q9D6T1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tube1Q9D6T1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tube1Q9D6T1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tube1Q9D6T1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tube1Q9D6T1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tube1Q9D6T1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tube1Q9D6T1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tube1Q9D6T1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tube1Q9D6T1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tube1Q9D6T1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tube1Q9D6T1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tube1Q9D6T1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tube1Q9D6T1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tube1Q9D6T1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tube1Q9D6T1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tube1Q9D6T1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tube1Q9D6T1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tube1Q9D6T1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tube1Q9D6T1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tube1Q9D6T1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tube1Q9D6T1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tube1Q9D6T1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tube1Q9D6T1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tube1Q9D6T1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tube1Q9D6T1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tube1Q9D6T1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tube1Q9D6T1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tube1Q9D6T1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tube1Q9D6T1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tube1Q9D6T1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tube1Q9D6T1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tube1Q9D6T1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tube1Q9D6T1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tube1Q9D6T1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tube1Q9D6T1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tube1Q9D6T1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tube1Q9D6T1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tube1Q9D6T1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tube1Q9D6T1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tube1Q9D6T1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tube1Q9D6T1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tube1Q9D6T1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tube1Q9D6T1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tube1Q9D6T1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tube1Q9D6T1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tube1Q9D6T1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tube1Q9D6T1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tube1Q9D6T1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tube1Q9D6T1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tube1Q9D6T1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tube1Q9D6T1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tube1Q9D6T1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tube1Q9D6T1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tube1Q9D6T1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tube1Q9D6T1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tube1Q9D6T1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tube1Q9D6T1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tube1Q9D6T1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tube1Q9D6T1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tube1Q9D6T1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Tube1Q9D6T1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tube1Q9D6T1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tube1Q9D6T1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tube1Q9D6T1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tube1Q9D6T1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tube1Q9D6T1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tube1Q9D6T1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tube1Q9D6T1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tube1Q9D6T1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tube1Q9D6T1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tube1Q9D6T1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tube1Q9D6T1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tube1Q9D6T1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tube1Q9D6T1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tube1Q9D6T1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tube1Q9D6T1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tube1Q9D6T1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tube1Q9D6T1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tube1Q9D6T1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tube1Q9D6T1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tube1Q9D6T1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms