Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nol3Q9D1X0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nol3Q9D1X0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms