Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lsm12Q9D0R8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lsm12Q9D0R8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lsm12Q9D0R8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lsm12Q9D0R8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lsm12Q9D0R8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lsm12Q9D0R8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lsm12Q9D0R8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lsm12Q9D0R8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lsm12Q9D0R8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lsm12Q9D0R8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lsm12Q9D0R8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lsm12Q9D0R8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lsm12Q9D0R8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lsm12Q9D0R8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lsm12Q9D0R8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lsm12Q9D0R8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lsm12Q9D0R8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lsm12Q9D0R8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lsm12Q9D0R8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Lsm12Q9D0R8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lsm12Q9D0R8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lsm12Q9D0R8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lsm12Q9D0R8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lsm12Q9D0R8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lsm12Q9D0R8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lsm12Q9D0R8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lsm12Q9D0R8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lsm12Q9D0R8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lsm12Q9D0R8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lsm12Q9D0R8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lsm12Q9D0R8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lsm12Q9D0R8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lsm12Q9D0R8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lsm12Q9D0R8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lsm12Q9D0R8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lsm12Q9D0R8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lsm12Q9D0R8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lsm12Q9D0R8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lsm12Q9D0R8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lsm12Q9D0R8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lsm12Q9D0R8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lsm12Q9D0R8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms