Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prkrip1Q9CWV6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prkrip1Q9CWV6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prkrip1Q9CWV6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prkrip1Q9CWV6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Prkrip1Q9CWV6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Prkrip1Q9CWV6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Prkrip1Q9CWV6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Prkrip1Q9CWV6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Prkrip1Q9CWV6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Prkrip1Q9CWV6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Prkrip1Q9CWV6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Prkrip1Q9CWV6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prkrip1Q9CWV6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prkrip1Q9CWV6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prkrip1Q9CWV6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prkrip1Q9CWV6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prkrip1Q9CWV6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prkrip1Q9CWV6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prkrip1Q9CWV6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prkrip1Q9CWV6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prkrip1Q9CWV6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prkrip1Q9CWV6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prkrip1Q9CWV6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prkrip1Q9CWV6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prkrip1Q9CWV6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prkrip1Q9CWV6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prkrip1Q9CWV6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prkrip1Q9CWV6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prkrip1Q9CWV6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prkrip1Q9CWV6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prkrip1Q9CWV6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prkrip1Q9CWV6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prkrip1Q9CWV6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prkrip1Q9CWV6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prkrip1Q9CWV6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prkrip1Q9CWV6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prkrip1Q9CWV6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prkrip1Q9CWV6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Prkrip1Q9CWV6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prkrip1Q9CWV6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prkrip1Q9CWV6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prkrip1Q9CWV6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prkrip1Q9CWV6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prkrip1Q9CWV6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prkrip1Q9CWV6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prkrip1Q9CWV6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prkrip1Q9CWV6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prkrip1Q9CWV6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prkrip1Q9CWV6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prkrip1Q9CWV6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prkrip1Q9CWV6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prkrip1Q9CWV6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prkrip1Q9CWV6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prkrip1Q9CWV6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prkrip1Q9CWV6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prkrip1Q9CWV6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prkrip1Q9CWV6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Prkrip1Q9CWV6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prkrip1Q9CWV6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prkrip1Q9CWV6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prkrip1Q9CWV6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prkrip1Q9CWV6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prkrip1Q9CWV6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prkrip1Q9CWV6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prkrip1Q9CWV6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prkrip1Q9CWV6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prkrip1Q9CWV6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prkrip1Q9CWV6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prkrip1Q9CWV6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prkrip1Q9CWV6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prkrip1Q9CWV6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prkrip1Q9CWV6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prkrip1Q9CWV6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prkrip1Q9CWV6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prkrip1Q9CWV6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Prkrip1Q9CWV6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prkrip1Q9CWV6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prkrip1Q9CWV6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prkrip1Q9CWV6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prkrip1Q9CWV6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prkrip1Q9CWV6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prkrip1Q9CWV6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prkrip1Q9CWV6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prkrip1Q9CWV6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prkrip1Q9CWV6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Prkrip1Q9CWV6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prkrip1Q9CWV6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prkrip1Q9CWV6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prkrip1Q9CWV6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prkrip1Q9CWV6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prkrip1Q9CWV6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prkrip1Q9CWV6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Prkrip1Q9CWV6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Prkrip1Q9CWV6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Prkrip1Q9CWV6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Prkrip1Q9CWV6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Prkrip1Q9CWV6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms