Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smim8Q9CQQ0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms