Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ndufb9Q9CQJ8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ndufb9Q9CQJ8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ndufb9Q9CQJ8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ndufb9Q9CQJ8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ndufb9Q9CQJ8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ndufb9Q9CQJ8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ndufb9Q9CQJ8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ndufb9Q9CQJ8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ndufb9Q9CQJ8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ndufb9Q9CQJ8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ndufb9Q9CQJ8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ndufb9Q9CQJ8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ndufb9Q9CQJ8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ndufb9Q9CQJ8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ndufb9Q9CQJ8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ndufb9Q9CQJ8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ndufb9Q9CQJ8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ndufb9Q9CQJ8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ndufb9Q9CQJ8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ndufb9Q9CQJ8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ndufb9Q9CQJ8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ndufb9Q9CQJ8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ndufb9Q9CQJ8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ndufb9Q9CQJ8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ndufb9Q9CQJ8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ndufb9Q9CQJ8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ndufb9Q9CQJ8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ndufb9Q9CQJ8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ndufb9Q9CQJ8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ndufb9Q9CQJ8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ndufb9Q9CQJ8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ndufb9Q9CQJ8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ndufb9Q9CQJ8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ndufb9Q9CQJ8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ndufb9Q9CQJ8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ndufb9Q9CQJ8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ndufb9Q9CQJ8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ndufb9Q9CQJ8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ndufb9Q9CQJ8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ndufb9Q9CQJ8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ndufb9Q9CQJ8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ndufb9Q9CQJ8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ndufb9Q9CQJ8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ndufb9Q9CQJ8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ndufb9Q9CQJ8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ndufb9Q9CQJ8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ndufb9Q9CQJ8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ndufb9Q9CQJ8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ndufb9Q9CQJ8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ndufb9Q9CQJ8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ndufb9Q9CQJ8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ndufb9Q9CQJ8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ndufb9Q9CQJ8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ndufb9Q9CQJ8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ndufb9Q9CQJ8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ndufb9Q9CQJ8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ndufb9Q9CQJ8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ndufb9Q9CQJ8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ndufb9Q9CQJ8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ndufb9Q9CQJ8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ndufb9Q9CQJ8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ndufb9Q9CQJ8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ndufb9Q9CQJ8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ndufb9Q9CQJ8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ndufb9Q9CQJ8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ndufb9Q9CQJ8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ndufb9Q9CQJ8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ndufb9Q9CQJ8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ndufb9Q9CQJ8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ndufb9Q9CQJ8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ndufb9Q9CQJ8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ndufb9Q9CQJ8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ndufb9Q9CQJ8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ndufb9Q9CQJ8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ndufb9Q9CQJ8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ndufb9Q9CQJ8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ndufb9Q9CQJ8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ndufb9Q9CQJ8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ndufb9Q9CQJ8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ndufb9Q9CQJ8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ndufb9Q9CQJ8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ndufb9Q9CQJ8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ndufb9Q9CQJ8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ndufb9Q9CQJ8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1747.9 ms