Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp6v0e1Q9CQD8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms