Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ2

Trim11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim11Q99PQ2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim11Q99PQ2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim11Q99PQ2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trim11Q99PQ2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim11Q99PQ2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim11Q99PQ2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim11Q99PQ2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim11Q99PQ2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim11Q99PQ2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim11Q99PQ2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim11Q99PQ2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim11Q99PQ2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim11Q99PQ2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim11Q99PQ2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim11Q99PQ2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim11Q99PQ2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim11Q99PQ2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim11Q99PQ2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms