Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Cmtm3Q99LJ5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cmtm3Q99LJ5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm3Q99LJ5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm3Q99LJ5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm3Q99LJ5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm3Q99LJ5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm3Q99LJ5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm3Q99LJ5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm3Q99LJ5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmtm3Q99LJ5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmtm3Q99LJ5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmtm3Q99LJ5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmtm3Q99LJ5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmtm3Q99LJ5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmtm3Q99LJ5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm3Q99LJ5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm3Q99LJ5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm3Q99LJ5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm3Q99LJ5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm3Q99LJ5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm3Q99LJ5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm3Q99LJ5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm3Q99LJ5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm3Q99LJ5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm3Q99LJ5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmtm3Q99LJ5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmtm3Q99LJ5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmtm3Q99LJ5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmtm3Q99LJ5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmtm3Q99LJ5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm3Q99LJ5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm3Q99LJ5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm3Q99LJ5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cmtm3Q99LJ5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms